各校對論文格式有各自的規范要求，論文編排能使論文內容整體結構層次分明。論文格式的排列是否有序可能也會對論文的重復率產生一定的影響，那么論文格式的排版在論文中也占據了比較重要的比重，那么論文格式的排版會不會對論文的重復率產生，PaperKeey是一款提高論文寫作效率的輔助工具，集查重、自動改重、在線同步改、實時查重于一身，是一款能夠自動進行改重的論文查重系統。
如果論文錯落有致，也可能影響論文查重報告的字數總和；如果論文格式相對規范，那么論文查重系統就會自動識別目錄、參考文獻等內容，并對其中的內容進行比對，最終得出全文的重復率。
論文格式對于參考文獻的引用也有影響，論文查重系統可以根據排版的方式，對參考文獻中的引用部分進行識別，得出查重結果。論文中有些內容是軟件一鍵生成的，比如論文目錄是Word自動生成的，檢測時可以自動識別，從而對各部分章節內容進行判斷，得出檢測結果。
論文排版這個問題其實很多同學都會忽視，有些同學還會直接去套用別人的模板，這樣就有可能造成復寫率太高的情況出現。論文的錯別字會不會對檢測結果的準確性有影響，論文查重中的字會不會對報表有影響等等這些問題都需要大家事先弄明白，所以一定要嚴格按照學校的標準把論文的格式做好。
對于論文格式排版的問題，在了解了學校的具體要求后，再根據要求進行調整，從而有效地避免了由于格式問題造成查重不過關的情況發生。